男，1964年8月生。1987年毕业于中山医科大学获临床医学学士学位，1992年获得北京医科大学获博士学位。现任北京大学博雅讲席教授、北京大学人民医院血液科主任、北京大学血液病研究所所长、国家血液系统疾病临床医学研究中心主任。2022年获聘中国医学科学院学术咨询委员会学部委员，2023年当选中国工程院院士。

       黄晓军教授长期聚焦白血病等其他恶性血液疾病的前沿研究和临床治疗，创建骨髓移植中国科学新方案—“北京方案”，解决了“供者来源匮乏”这一世界性医学难题，使亲属成为移植供者的概率由不足25%上升至接近100%；显著提高了患者生存，使半相合移植治疗白血病的3年生存率从约20%升至70%左右。北京方案改变了世界半相合移植“不可逾越”的传统观念，使半相合移植成为白血病一线治疗方案，促进了全球白血病和骨髓移植学科的在最近20年的长足进步。

       先后获国家科技进步二等奖2项、省部级一等奖4项、何梁何利科学技术与进步奖，谈家桢生命科学临床医学奖，转化医学杰出贡献奖，吴阶平医药创新奖，中国工程院光华工程科技奖。

      兼任亚太血液联盟常委会主任、世界华人医师协会第四届理事会副会长、第四、五届中国医师协会血液科医师分会会长、第九届中华医学会血液学分会主委。